Agilent N4421B-H67基因表达分析

使用 Agilent MassHunter 定量分析软件10.1 中提供的 GC/Q-TOF 筛查工作流程以及农药与环境污染物的精确质量农药个人化合物数据库与谱库 (PCDL) 对 GC/Q-TOF数据进行处理，该 PCDL 中包含 1000 多种特有的化合物（图 2A）。简而言之，将 GC/Q-TOF 数据导入 MassHunter 定量分析软件中，并转换为 SureMass 格式，以提高下游数据分析的速度和质量。利用GC/Q-TOF 精确质量谱库（图 3）自动创建了一种组合式筛查和定量分析方法。现在，最新的 GC/Q-TOF PCDL 中包含了更多以下类别的化合物：多环芳烃 (PAH)、胺类、有机磷酸酯、邻苯二甲酸酯、硝基苯胺和硝基氯苯。

筛查方法参数根据 SANTE 指导原则进行设置，并经过进一步优化以减少假阳性和假阴性结果的数量。这些参数包括 RT 窗口、质量数准确度、共流出得分和谱库匹配得分等。例如，将质量数准确度设定为 5 ppm（与 SANTE 指导原则一致），将 RT 窗口设定为 0.05 分钟。RT 锁定与反吹可提供优异的 RT 精密度和重现性，此设置有助于减少假阳性结果。谱库匹配得分设定为 75。后一项设置已针对此应用进行了优化，并且是消除假阳性结果的关键参数之一。对于大多数已确认的化合物，谱库匹配得分均高于 90。应用组合筛查方法后，只有少数边缘情况需要手动审查，以确定该化合物是否为真实匹配。这些化合物会在筛查器窗口中自动以橙色突出显示。此外，还使用 MassHunter 定量分析软件10.1 和 MassHunter 未知物分析软件以及定制的单位质量农药谱库对 GC/MSD 数据进行了处理。

使用 GC/Q-TOF 进行疑似物筛查为了测试 GC/Q-TOF 精确质量筛查工作流程，从北加州的不同零售商店和农贸市场购得 14 种有机和非有机草莓样品，并按上述方法制得提取物。在有机草莓提取物混合样品（利用 GC 单四极杆仪器未检出任何农药）中，以 1–500 ppb 的浓度加入非有机草莓生长时通常使用的 40 种优先农药[4]。利用该工作流程（图 2A）对选定的优先农药进行定量分析，同时对安捷伦 PCDL 中的许多其他农药和环境污染物进行快速疑似物筛查。利用该疑似物筛查方法对用于创建数据分析方法的 PCDL 中的所有化合物进行筛查。当鉴定出的化合物存在校准标样时，将报告其浓度。与之前的工作流程[5] 相比，此污染物筛查工作流程显著提高了分析效率，并大大简化了流程。它将各种功能结合到单一工具中，能够实现靶向定量分析和疑似物筛查。

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